Есть неплохая программа для сравнения файлов между собой для выявления отличий. Очень помогает в тех случаях, когда необходимо выявить различие более старшой версии файла над младшей. Жизненный пример: есть CMS, для нее выпустили обновление в виде нескольких php-файлов (или каких-то других, не важно), которые вам надо закинуть в нужные директории с заменой старых. Вы — человек пытливый, и вам не хочется просто тупо заменять файлы. Вам нужно разобраться, что именно разработчики CMS подправили, какая уязвимость или баг был (об этом не всегда пишут в change-логах). И вот тут на помощь приходит WinMarge — открываете два файла для сравнения и программа выдает подсвеченные места, в которых имеются различия.